Fishes of the World năm 2006 của Nelson phân chia phân lớp này như sau:

• Phân lớp Elasmobranchii
  • †Plesioselachus
  • †Bộ Squatinactiformes
  • †Bộ Protacrodontiformes
  • †Phân thứ lớp Cladoselachimorpha
    • †Bộ Cladoselachiformes
  • †Phân thứ lớp Xenacanthimorpha
    • †Bộ Xenacanthiformes
  • Phân thứ lớp Euselachii (cá mập và cá đuối)
    • †Bộ Ctenacanthiformes
    • †Tiểu lớp Hybodonta
      • †Bộ Hybodontiformes
    • Tiểu lớp Neoselachii
      • Đại bộ Selachii (cá mập/cá nhám hiện đại)
        • Liên bộ Galeomorphi
          • Bộ Heterodontiformes (cá nhám đầu bò, cá nhám hổ)
          • Bộ Orectolobiformes (cá nhám thảm)
          • Bộ Lamniformes (cá nhám thu, cá nhám chuột)
          • Bộ Carcharhiniformes (cá mập)
        • Liên bộ Squalomorphi
          • Bộ Hexanchiformes (cá nhám sáu mang)
          • Bộ Squaliformes (cá nhám góc)
          • †Bộ Protospinaciformes
          • Bộ Squatiniformes (cá nhám dẹp)
          • Bộ Pristiophoriformes (cá nhám cưa)
      • Đại bộ Batoidea (cá đuối)
        • • Bộ Torpediniformes (cá đuối điện)
          • Bộ Pristiformes (cá đao)
          • Bộ Rajiformes (cá đuối)
          • Bộ Myliobatiformes (cá đuối ó)

Các nghiên cứu phân tử gần đây gợi ý rằng Batoidea khong phải là các loài selachii phái sinh như suy nghĩ trước đây. Thay vì thế, các dạng cá đuối là một liên bộ đơn ngành trong phạm vi Elasmobranchii chia sẻ cùng một tổ tiên chung với Selachii.[3][4]